古菌爱好者周刊#试刊Vol.2:前沿文献|学界动态|科学与社会
《古菌爱好者周刊》试刊第二期,欢迎各位读者批评指正!本期关注近期古菌学文献10篇,学界动态1则,“科学与社会”1则。
一、前沿文献:
1. 上海交通大学徐俊课题组NAR:高静水压通过含胱硫醚-β-合酶域蛋白在超嗜热古菌Pyrococcus yayanosii中促进基因转录。Li C, Li S, Song Q, Da L tai, Xu J. High hydrostatic pressure promotes gene transcription via a cystathionine-β-synthase domain-containing protein in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus yayanosii. Nucleic Acids Res. 2025;53(1):gkae1289. doi:10.1093/nar/gkae1289
2. 扬州大学张立奎课题组NAR:由新型HhH-GPD家族蛋白介导的泉古菌烷基化DNA修复。Zhang L, Gao T, Li Z, et al. Alkylated DNA repair by a novel HhH-GPD family protein from Crenarchaea. Nucleic Acids Res. 2025;53(2):gkaf012. doi:10.1093/nar/gkaf012
3. 以色列内盖夫本-古里安大学Natalie Elia课题组EMBO J:_Asgard_古菌ESCRT-III系统形成螺旋状丝状结构并重塑类真核膜。Melnikov N, Junglas B, Halbi G, et al. The Asgard archaeal ESCRT-III system forms helical filaments and remodels eukaryotic-like membranes. EMBO J. Published online January 3, 2025. doi:10.1038/s44318-024-00346-4
4. 加拿大阿尔伯塔大学Joel B. Dacks课题组Nature Microbiology:参与真核细胞器动态的Arf家族GTP酶的Asgard古菌起源。Vargová R, Chevreau R, Alves M, et al. The Asgard archaeal origins of Arf family GTPases involved in eukaryotic organelle dynamics. Nat Microbiol. Published online January 23, 2025. doi:10.1038/s41564-024-01904-6
5. 法国巴斯德研究所Hugo Vaysset课题组Nature Microbiology:古菌与真核生物RNA引导RNA修饰在细菌IS110转座子中的进化起源。Vaysset H, Meers C, Cury J, Bernheim A, Sternberg SH. Evolutionary origins of archaeal and eukaryotic RNA-guided RNA modification in bacterial IS110 transposons. Nat Microbiol. 2025;10(1):20-27. doi:10.1038/s41564-024-01889-2
6. **美国康奈尔大学Kyle M. Lancaster课题组PNAS:硝化古菌_Nitrosopumilus maritimus_通过酶促亚硝基生成一氧化二氮的研究。**Voland RW, Wang H, Abruña HD, Lancaster KM. Nitrous oxide production via enzymatic nitroxyl from the nitrifying archaeon Nitrosopumilus maritimus. Proc Natl Acad Sci. 2025;122(3):e2416971122. doi:10.1073/pnas.2416971122
7. 美国加州大学伯克利分校Natalia N. Ivanova课题组Science Advances:从宏基因组视角看微生物原核基因组普查。Wu D, Seshadri R, Kyrpides NC, Ivanova NN. A metagenomic perspective on the microbial prokaryotic genome census. Sci Adv. 2025;11(3):eadq2166. doi:10.1126/sciadv.adq2166
媒体报道:微生物基因组的多样性:从培养到环境的全景视角. 环境微生物组学. 2025-01-21.
8. 新加坡南洋理工大学吴彬课题组JACS:高精度蛋白连接的结构基础及其应用。Chong KHC, Liu L, Chua R, et al. Structural Basis of High-Precision Protein Ligation and Its Application. J Am Chem Soc. 2025;147(2):1604-1611. doi:10.1021/jacs.4c10689
9. 捷克马萨里克大学Gabriel Demo课题组NAR:新型古菌核糖体二聚化因子促进独特的30S–30S二聚化。Hassan AH, Pinkas M, Yaeshima C, et al. Novel archaeal ribosome dimerization factor facilitating unique 30S–30S dimerization. Nucleic Acids Res. 2025;53(2):gkae1324. doi:10.1093/nar/gkae1324
10. 法国巴黎综合理工学院Emmanuelle Schmitt课题组Nature Communications:_Saccharolobus solfataricus_起始复合物与无引导序列mRNA的结构揭示古菌特征及其与真核生物的相似性。Bourgeois G, Coureux PD, Lazennec-Schurdevin C, et al. Structures of Saccharolobus solfataricus initiation complexes with leaderless mRNAs highlight archaeal features and eukaryotic proximity. Nat Commun. 2025;16(1):348. doi:10.1038/s41467-024-55718-5
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二、学界动态:
1. 新书发布:《细菌古菌系统分类学原理及鉴定技术》(中山大学李文均教授,刘兰助理研究员,焦建宇副教授和中国科学院新疆生态与地理研究所房保柱副研究员主编)
媒体报道:【新书推荐】细菌古菌系统分类学原理及鉴定技术 | 主编 李文均 刘兰 焦建宇 房保柱. 高教社农林医药与生命科学. 2025-01-21.
三、科学与社会:
1. PNAS 文章呼吁招聘部门和博士后重视博士后阶段的训练:①博士后阶段似乎比博士训练阶段更重要;②改变方向似乎是有益的,但不要太多。Duan Y, Memon SA, AlShebli B, Guan Q, Holme P, Rahwan T. Postdoc publications and citations link to academic retention and faculty success. Proc Natl Acad Sci USA. 2025;122(4):e2402053122. doi:10.1073/pnas.2402053122
往期回顾:
古菌爱好者周刊#试刊Vol.1. 2025-01-20
本期编辑: YK
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